বাংলাদেশে মোট ৬টি ইলিশের অভয়াশ্রম রয়েছে। নিচে এদের তালিকা দেয়া হলো:
১. চাঁদপুর জেলার ষাটনল থেকে লক্ষ্মীপুর জেলার চর আলেকজান্ডার (মেঘনা নদীর নিম্ন অববাহিকায় ১০০ কিমি এলাকা)।
২. ভোলা জেলার মদনপুর/চর ইলিশা থেকে চর পিয়াল (মেঘনা নদীর শাহবাজপুর শাখার ৯০ কিমি এলাকা)।
৩. ভোলা জেলার ভেদুরিয়া থেকে পটুয়াখালী জেলার চর রুস্তম (তেঁতুলিয়া নদীর প্রায় ১০০ কিমি এলাকা)।
৪. পটুয়াখালী জেলার কলাপাড়া উপজেলার আন্ধারমানিক নদীর ৪০ কিমি এলাকা।
৫. শরীয়তপুর জেলার নিম্ন পদ্মার ২০ কিমি এলাকা।
৬. বরিশাল জেলার হিজলা, মেদেন্দীগঞ্জ ও বরিশাল সদর উপজেলার কালাবদর, গজারিয়া ও মেঘনা নদীর প্রায় ৮২ কিলোমিটার এলাকা।
ইলিশের প্রজনন নির্বিঘ্ন করতে এবং এর বংশবৃদ্ধির জন্য এসব এলাকায় মাছ ধরা নিষিদ্ধ থাকে। সাধারণত প্রতি বছর মার্চ-এপ্রিল মাসে এসব অভয়াশ্রমে মাছ ধরা বন্ধ থাকে।